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烟草ABF转录因子基因克隆与生物信息研究获进展(图)

2014年07月09日 来源:烟草在线云南烟叶信息网报道 作者:杨春江
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  烟草在线云南烟叶信息网报道  大量研究表明,AREB/ABF转录因子在提高植物抗渗透胁迫能力、增强植物对逆境的适应性等方面具有重要作用。烟草作为功能基因组学研究的重要模式植物,具有易培养、自花授粉、易遗传转化、表型明显等优点,是基因功能研究的理想材料,而目前有关烟草ABF转录因子的研究尚为空白。

  为获得烟草AREB/ABF(ABA响应元件结合蛋白/ABRE结合因子)家族转录因子基因序列,进一步提高烟草的抗渗透胁迫能力,中国烟草总公司重大专项“烟草基因组编辑技术的建立与应用”[110201301011A(JY-11A)]课题组重庆大学生命科学学院等,通过同源比对和RT-PCR技术,从烟草品种红花大金元中克隆到烟草AREB/ABF家族转录因子NtABF1(GenBank登录号为KF736849),NtABF2(GenBank登录号为KF736850)基因编码序列,并进一步利用生物信息学分析软件对这两个转录因子的蛋白理化性质、高级结构和生物学功能进行了预测。

  生物信息学分析结果表明,NtABF1和NtABF2均含有保守的BRLZ结构域,不含跨膜区和信号肽,二者均定位于细胞核,且都含有Ser,Thr和Tyr激酶识别位点,与其他物种中该家族成员的结构特征一致(说明NtABF1和NtABF2均为典型的bZip转录因子家族成员)。序列比对和进化分析结果显示,NtABF1与拟南芥AtAREB3亲缘关系最近,序列同源性达54.49%;NtABF2与茄科植物番茄SlAREB1、马铃薯StABF1和StABF序列同源性分别为83.63%,83.52%和83.00%,二者与拟南芥及番茄、马铃薯ABF转录因子有类似的功能。进一步可通过构建NtABF1和NtABF2的植物过表达载体,转化烟草植株,分析转基因烟草的抗逆性,并结合凝胶阻滞实验(EMSA),验证其与ABRE元件的结合特异性,从而为深入研究NtABF1和NtABF2参与的逆境胁迫信号通路提供更多数据。 

  以上研究结果发表在《烟草科技》2014年第6期上。该项研究由重庆大学生命科学学院与西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室合作完成。

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